Schwarmintelligenz und Komplexe Systeme
CoRe-PA Übersicht
CoRe-PA ist eine Programm zur Rekonstruktion der koevolutionären Geschichte von Wirt-Parasit-Systemen. Wie Tarzan verwendet es ein ereignisbasiertes Modell um kostenminimale Rekonstruktionen zu finden. Diese Ereignisse sind Kospeziation, Sorting, Duplikation und Wirtswechsel.
Mit CoRe-PA kann man:
- Wirt-Parasit-System mit einem grafischen Editor erstellen
- zufällige koevolutionäre System mit Hilfe des Beta-Split Modelles (beta 0, -1 oder -1,5) erzeugen
- zufällige koevolutionäre System durch Simulation von Koevolution erzeugen
- zufällige koevolutionäre System erzeugen, die den “Charakter” eines gegebenen koevolutionären Systems beibehalten
- nicht-binäre Wirt-Parasit-Phylogenien analysieren
- zwischen verschiedenen Verfahrensweisen bei Wirtswechseln wählen
- Zeitinformationen über Speziationsereignisse verwenden
- die günstigsten Rekonstruktionen für gegebene Ereigniskosten berechnen
- die besten Ereigniskosten für ein Wirt-Parasit-System bestimmen (wobei die Ereigniskosten am besten zu den beobachten Ereignishäufigkeiten passen)
- randomisierte Tests für ein gegebenes Wirt-Parasit-System durchführen
- Wirt-Parasit-Systeme und ihre Rekonstruktionen als SVG exportieren